MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_94

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015741	T	7	7	4	10	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015741	CAG	2	6	71	76	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015741	A	6	6	81	86	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015741	CA	3	6	87	92	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015741	GTCAA	2	10	6775	6784	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015741	CCCG	2	8	9919	9926	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_015741	GGGTC	2	10	10681	10690	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015741	TGCAG	2	10	10782	10791	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015741	CG	4	8	11650	11657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015741	TTG	2	6	13227	13232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015741	AC	3	6	15358	15363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015741	GC	3	6	17422	17427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015741	TGCA	2	8	17465	17472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015741	AGC	2	6	17516	17521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015741	TG	3	6	21004	21009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015741	GGAG	2	8	21060	21067	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015741	GGA	2	6	21120	21125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015741	GA	3	6	21286	21291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015741	GGC	2	6	21459	21464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015741	TGC	2	6	21510	21515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015741	CTTC	2	8	24796	24803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015741	CCT	2	6	24837	24842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015741	GTC	2	6	27740	27745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015741	GGGCC	2	10	27795	27804	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015741	CTC	2	6	28910	28915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_015741	GCA	2	6	29461	29466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015741	TTA	2	6	29484	29489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015741	GGC	2	6	29599	29604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015741	TGC	2	6	29679	29684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015741	CAG	2	6	30899	30904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015741	TGT	2	6	30940	30945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015741	GTC	2	6	30953	30958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015741	GTT	2	6	30980	30985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015741	CAC	2	6	31015	31020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_015741	CAT	2	6	31064	31069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015741	TC	3	6	31142	31147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015741	CAAT	2	8	31301	31308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015741	GTTTA	2	10	31320	31329	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015741	GCACG	2	10	32225	32234	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_015741	CGT	2	6	32265	32270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015741	GGAAC	2	10	32356	32365	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_015741	CA	3	6	36861	36866	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015741	AGGGT	2	10	36959	36968	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015741	TG	3	6	37024	37029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015741	TGC	2	6	37034	37039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015741	T	7	7	38821	38827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015741	AG	3	6	38848	38853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015741	GCA	2	6	38876	38881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015741	GTC	2	6	41457	41462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015741	GTT	2	6	43191	43196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015741	AAGC	2	8	43247	43254	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015741	TG	3	6	43258	43263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015741	CAA	2	6	43297	43302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015741	CAGG	2	8	43343	43350	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015741	TGC	2	6	43391	43396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015741	GGT	2	6	43398	43403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015741	CTG	2	6	43423	43428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015741	CGC	2	6	43433	43438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_015741	CGG	2	6	43462	43467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015741	TCA	2	6	43489	43494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015741	GGGCG	2	10	44625	44634	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015741	TTTTG	2	10	44712	44721	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015741	GGT	2	6	44767	44772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015741	CGC	2	6	48784	48789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015741	TCC	2	6	48802	48807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015741	TGC	2	6	48808	48813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015741	GC	3	6	48812	48817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015741	GCA	2	6	48853	48858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015741	CG	4	8	48874	48881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015741	ATG	2	6	48902	48907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015741	ACC	2	6	48944	48949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015741	CGC	2	6	49012	49017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015741	ACC	2	6	50827	50832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_015741	AAG	2	6	50855	50860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015741	GC	3	6	50870	50875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015741	ACT	2	6	53742	53747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015741	CCGCCT	2	12	53828	53839	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_015741	CATAA	2	10	53850	53859	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015741	CGG	2	6	53988	53993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015741	GCC	2	6	54017	54022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_015741	TG	3	6	54029	54034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015741	TCG	2	6	54081	54086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015741	CAC	3	9	54121	54129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015741	TAA	2	6	54169	54174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015741	CAT	2	6	54204	54209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015741	CCT	2	6	54457	54462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_015741	TGAA	2	8	54463	54470	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015741	TAA	2	6	54479	54484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015741	ATA	2	6	54508	54513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015741	TGC	2	6	54603	54608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015741	A	6	6	54609	54614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015741	CGGAC	2	10	54706	54715	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_015741	ATT	2	6	57366	57371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015741	AGC	2	6	59987	59992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015741	GCT	2	6	59993	59998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015741	CTG	2	6	60016	60021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015741	GCC	2	6	60056	60061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_015741	GC	3	6	60064	60069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015741	AT	3	6	60097	60102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015741	CAG	2	6	60112	60117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015741	GGGC	2	8	60131	60138	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015741	ATC	2	6	60144	60149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015741	TGAT	2	8	60159	60166	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015741	TGC	2	6	60186	60191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015741	CTA	2	6	60228	60233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015741	GAC	2	6	60313	60318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015741	GC	4	8	60435	60442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015741	ACC	2	6	60459	60464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_015741	CCA	2	6	60466	60471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_015741	GC	3	6	60485	60490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015741	GGT	2	6	63205	63210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015741	CCTG	2	8	64172	64179	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015741	GGC	2	6	64189	64194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015741	TCG	2	6	65686	65691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015741	TCA	2	6	68072	68077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015741	TTG	2	6	68089	68094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015741	CTG	2	6	69227	69232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015741	ATC	2	6	69239	69244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015741	GCT	2	6	69275	69280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015741	GCA	2	6	69346	69351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015741	GCT	2	6	69401	69406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015741	CG	3	6	75609	75614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015741	AT	4	8	75639	75646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015741	TCAAA	2	10	75674	75683	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015741	GC	3	6	82814	82819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015741	AGG	2	6	85919	85924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015741	GCAA	2	8	91434	91441	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015741	GCG	2	6	91924	91929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015741	TTTGC	2	10	91932	91941	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015741	AGC	2	6	91956	91961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015741	GC	4	8	92017	92024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015741	AACC	2	8	92141	92148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015741	CCA	2	6	92219	92224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_015741	GTCAG	2	10	93226	93235	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015741	CAGTT	2	10	93308	93317	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015741	TC	3	6	93325	93330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015741	CGG	2	6	93472	93477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015741	GCAC	2	8	93490	93497	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.